Wo die Deutsche Bahn durch Bauarbeiten in die Umwelt eingreifen muss, sorgt sie mit gezielten Maßnahmen für einen ökologischen Ausgleich. So werden zum Beispiel Biotope geschaffen und Wildpferde als Landschaftspfleger eingesetzt.

In der Nähe von Hanau und Aschaffenburg sorgen die sogenannten Przewalski-Pferde dafür, dass Büsche und Bäume kurzgehalten werden und so die Flächen im Naturschutzgebiet nicht zuwuchern. Gleichzeitig schaffen sie vielfältige Strukturen und offene Bodenstellen. So bleibt Lebensraum für viele Pflanzen- und Tierarten erhalten. Solche Ausgleichsmaßnahmen kommen immer dann zum Einsatz, wenn Eingriffe unvermeidlich sind, wie beispielsweise beim Bau eines neuen Tunnels zwischen Aschaffenburg und Würzburg.